I transiti di animali e prodotti animali tra Stati membri dell'UE non sono soggetti al controllo veterinario di confine. Tuttavia, nel caso dei trasporti di animali, occorre osservare assolutamente i seguenti punti. La mancata osservanza di tali condizioni può dare luogo a contestazioni da parte degli organi d'esecuzione cantonali.

-    Se per gli animali nell'ambito degli scambi intracomunitari è obbligatorio un certificato di sanità il documento, unito a un piano di trasporto eventualmente necessario, deve sempre accompagnare gli animali.

-    Il transito su strada di ungulati è severamente vietato per motivi legati alla protezione degli animali.

-    Per il transito di cani, gatti e furetti si applicano le medesime condizioni valide per l'importazione dall'UE.